生物大分子

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2025年08月05日， 星期二 (展示 3 之 3 条目 )

[1] arXiv:2508.01924 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： Pi-SAGE：用于结合亲和力预测的排列不变表面感知图编码器 显示英文标题

标题： Pi-SAGE: Permutation-invariant surface-aware graph encoder for binding affinity prediction

Sharmi Banerjee, Mostafa Karimi, Melih Yilmaz, Tommi Jaakkola, Bella Dubrov, Shang Shang, Ron Benson

期刊参考： PMLR 267，2025

主题： 生物大分子 (q-bio.BM)

[2] arXiv:2508.01799 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于溶剂感知增强的对比多任务学习在药物发现中的应用 显示英文标题

标题： Contrastive Multi-Task Learning with Solvent-Aware Augmentation for Drug Discovery

Jing Lan, Hexiao Ding, Hongzhao Chen, Yufeng Jiang, Ng Nga Chun, Gerald W.Y. Cheng, Zongxi Li, Jing Cai, Liang-ting Lin, Jung Sun Yoo

评论： 10页，4图

主题： 生物大分子 (q-bio.BM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 机器学习 (cs.LG)

[3] arXiv:2508.01055 (交叉列表自 cs.LG) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： FGBench：大型语言模型中功能团级分子性质推理的数据集和基准 显示英文标题

标题： FGBench: A Dataset and Benchmark for Molecular Property Reasoning at Functional Group-Level in Large Language Models

Xuan Liu, Siru Ouyang, Xianrui Zhong, Jiawei Han, Huimin Zhao

评论： 20页，20图

主题： 机器学习 (cs.LG) ; 人工智能 (cs.AI) ; 生物大分子 (q-bio.BM) ; 定量方法 (q-bio.QM)

2025年08月04日， 星期一 (展示 1 之 1 条目 )

[4] arXiv:2508.00578 (交叉列表自 cs.LG) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 学习肽中氢原子转移反应的势能面 显示英文标题

标题： Learning Potential Energy Surfaces of Hydrogen Atom Transfer Reactions in Peptides

Marlen Neubert, Patrick Reiser, Frauke Gräter, Pascal Friederich

评论： 19页，12图和4表（参考文献和补充信息包括在内）

主题： 机器学习 (cs.LG) ; 材料科学 (cond-mat.mtrl-sci) ; 化学物理 (physics.chem-ph) ; 计算物理 (physics.comp-ph) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

2025年08月01日， 星期五 (展示 1 之 1 条目 )

[5] arXiv:2507.23481 (交叉列表自 q-bio.PE) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 控制蛋白质可进化性的因素，分子尺度上 显示英文标题

标题： Factors controlling protein evolvability, at the molecular scale

Jorge A. Vila

主题： 种群与进化 (q-bio.PE) ; 生物大分子 (q-bio.BM)

2025年07月31日， 星期四 (展示 1 之 1 条目 )

[6] arXiv:2507.22068 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 仿生工程强化冰复合材料以提高机械性能 显示英文标题

标题： Biomimetic Engineering of a Fortified Ice Composite with Enhanced Mechanical Properties

Chen Adar, Yulia Baron, Baruch Rofman, Maya Bar-Dolev, Liat Bahari, Victor Yashunsky, Vera Sirotinskaya, Oded Shoseyov, Ido Braslavsky

主题： 生物大分子 (q-bio.BM) ; 材料科学 (cond-mat.mtrl-sci) ; 生物物理 (physics.bio-ph) ; 医学物理 (physics.med-ph)

2025年07月30日， 星期三 (展示 2 之 2 条目 )

[7] arXiv:2507.21417 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于持久拓扑拉普拉斯的病毒样颗粒化学计量和稳定性的机器学习预测 显示英文标题

标题： Machine-Learning Prediction of Virus-like Particle Stoichiometry and Stability using Persistent Topological Laplacians

Xiang Liu, Xuefei Huang, Guo-Wei Wei

主题： 生物大分子 (q-bio.BM)

[8] arXiv:2507.21938 (交叉列表自 cs.LG) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于DynamicMPNN的多状态蛋白质设计 显示英文标题

标题： Multi-state Protein Design with DynamicMPNN

Alex Abrudan, Sebastian Pujalte Ojeda, Chaitanya K. Joshi, Matthew Greenig, Felipe Engelberger, Alena Khmelinskaia, Jens Meiler, Michele Vendruscolo, Tuomas P. J. Knowles

评论： ICML 2025 基因组学研讨会

主题： 机器学习 (cs.LG) ; 生物大分子 (q-bio.BM)