种群与进化

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2026年02月03日， 星期二 (展示 4 之 4 条目 )

[1] arXiv:2601.22193 (交叉列表自 q-bio.PE) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 距离受限的系统发育匹配的结构特性 显示英文标题

标题： Structural properties of distance-bounded phylogenetic reconciliation

Azadeh Aghaeeyan, Pouria Ramazi

评论： 要阅读和理解这篇论文，不需要系统发育或共系统发育方面的背景。所使用的工具是图论的。

主题： 种群与进化 (q-bio.PE)

[2] arXiv:2601.22177 (交叉列表自 q-bio.PE) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 竞争物种在环境压力和合作下的涌现空间组织 显示英文标题

标题： Emergent spatial organization of competing species under environmental stress and cooperation

Sten Madec (IDP, UT), Nicola Cinardi (IST / Técnico Lisboa), Erida Gjini (ITN (ULisboa))

主题： 种群与进化 (q-bio.PE) ; 动力系统 (math.DS)

[3] arXiv:2602.01492 (交叉列表自 q-bio.PE) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 从离散到连续的顺从者、非顺从者和模仿者的混合种群 显示英文标题

标题： From Discrete to Continuous Mixed Populations of Conformists, Nonconformists, and Imitators

Nam H. Le

主题： 种群与进化 (q-bio.PE) ; 系统与控制 (eess.SY)

[4] arXiv:2601.18818 (交叉列表自 q-bio.QM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 标签KAN——用于标签间学习的柯尔莫哥洛夫-阿诺德网络：鸟类群落学习 显示英文标题

标题： LabelKAN -- Kolmogorov-Arnold Networks for Inter-Label Learning: Avian Community Learning

Neelima Sharma, Madhusudhan Venkadesan

主题： 定量方法 (q-bio.QM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 种群与进化 (q-bio.PE)

2026年02月02日， 星期一 (展示 5 之 5 条目 )

[5] arXiv:2601.20416 (交叉列表自 q-bio.PE) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 促进具有增长合并动力学的群体结构中的合作 显示英文标题

标题： Promotion of cooperation in deme-structured populations with growth-merging dynamics

Benedetta Ciarmoli, Sophie Marbach

评论： 27页，5图

主题： 种群与进化 (q-bio.PE)

[6] arXiv:2601.19064 (交叉列表自 q-bio.PE) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： LvD：一种计算系统发育似然性的新算法 显示英文标题

标题： LvD: A New Algorithm for Computing the Likelihood of a Phylogeny

Rubén Calvo, Adrián Roig, Roberto Corral López, José Camacho-Mateu, José A. Cuesta, Miguel A. Muñoz

主题： 种群与进化 (q-bio.PE) ; 数据结构与算法 (cs.DS)

[7] arXiv:2601.22619 (交叉列表自 q-bio.PE) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 表观遗传状态继承驱动实体瘤中耐药持续性诱导的耐药性：一种随机基于代理的模型 显示英文标题

标题： Epigenetic state inheritance drivers drug-tolerant persister-induced resistance in solid tumors: A stochastic agent-based model

Xiyin Liang, Jinzhi Lei

评论： 38页，14幅图

主题： 种群与进化 (q-bio.PE)

[8] arXiv:2601.20981 (交叉列表自 cs.NE) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 通过物种分化在大型语言模型中多样化毒性搜索 显示英文标题

标题： Diversifying Toxicity Search in Large Language Models Through Speciation

Cyriac Antony, Alessio Martino, Blerina Sinaimeri

评论： 预印本。12页

主题： 神经与进化计算 (cs.NE) ; 种群与进化 (q-bio.PE)

[9] arXiv:2601.22918 (交叉列表自 q-bio.PE) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 微生物组关联多样性反映了接近不稳定边缘的程度 显示英文标题

标题： Microbiome association diversity reflects proximity to the edge of instability

Ton Viet Ta

主题： 种群与进化 (q-bio.PE) ; 定量方法 (q-bio.QM)

2026年01月30日， 星期五 (展示 4 之 4 条目 )

[10] arXiv:2601.21480 (交叉列表自 q-bio.PE) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 调控DNA序列的长期进化。 第二部分：理论与未来挑战 显示英文标题

标题： Long-term evolution of regulatory DNA sequences. Part 2: Theory and future challenges

Elia Mascolo, Réka Borbély, Noa Ottilie Borst, Nicholas H Barton, Justin Crocker, Gašper Tkačik

评论： 特邀综述（两部分系列的第二部分），已提交至《Current Opinion in Genetics & Development》。第一部分见arXiv:2601.19681

主题： 种群与进化 (q-bio.PE)

[11] arXiv:2601.19681 (交叉列表自 q-bio.PE) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 调控DNA序列的长期进化。 第1部分：关于全局、生物物理现实的基因型-表型映射的模拟 显示英文标题

标题： Long-term evolution of regulatory DNA sequences. Part 1: Simulations on global, biophysically-realistic genotype-phenotype maps

Fabio Mazza, Gabriele Ricci, Francesca Colaiori, Stefano Guarino, Sandro Meloni, Fabio Saracco

评论： 特邀评论（两部分系列文章第一部分），已投稿至《当前遗传学与发育生物学观点》

主题： 种群与进化 (q-bio.PE)

[12] arXiv:2602.00978 (交叉列表自 cs.NE) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 生物体的能动性与快速适应：表型优先进化的表型生成算法 显示英文标题

标题： Organismal Agency and Rapid Adaptation: The Phenopoiesis Algorithm for Phenotype-First Evolution

Maximillian Newman

评论： 22页，2图，

主题： 神经与进化计算 (cs.NE) ; 种群与进化 (q-bio.PE)

[13] arXiv:2601.20771 (交叉列表自 q-bio.PE) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 跨国学习用于使用欧洲数据的国家传染病预测 显示英文标题

标题： Cross-Country Learning for National Infectious Disease Forecasting Using European Data

Onkar Shelar, Travis Desell

评论： 7页，4图，5表

主题： 种群与进化 (q-bio.PE) ; 机器学习 (cs.LG)

2026年01月29日， 星期四 (展示 4 之 4 条目 )

[14] arXiv:2601.21079 (交叉列表自 math.PR) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 二倍体种群模型在具有大迁移和不均子代分布的有限图上的淬火结构凝聚过程 显示英文标题

标题： The quenched structured coalescent for diploid population models on finite graphs with large migrations and uneven offspring distributions

Zacharias Komodromos, Kleanthis Malialis, Artemis Kontou, Panayiotis Kolios

评论： 41页，2图

主题： 概率 (math.PR) ; 种群与进化 (q-bio.PE)

[15] arXiv:2601.21743 (交叉列表自 physics.soc-ph) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 行为异质性对流行病结果的影响及其映射到有效网络拓扑结构 显示英文标题

标题： Impact of behavioral heterogeneity on epidemic outcome and its mapping into effective network topologies

Pablo Moreno-Spiegelberg, Javier Aguilar

评论： 13页，7图

主题： 物理与社会 (physics.soc-ph) ; 种群与进化 (q-bio.PE)

[16] arXiv:2601.20123 (交叉列表自 math.DS) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 不道德日托中心的最优疾病政策 显示英文标题

标题： Optimal illness policy for an unethical daycare center

Damien Ribière, Alia Abbara, Anne-Florence Bitbol

主题： 动力系统 (math.DS) ; 种群与进化 (q-bio.PE)

[17] arXiv:2601.20670 (交叉列表自 q-bio.PE) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 噪声诱导的兴奋性：自毒种群动力学中的爆发、崩溃和灭绝 显示英文标题

标题： Noise-induced excitability: bloom, bust and extirpation in autotoxic population dynamics

Lauren D Smith

主题： 种群与进化 (q-bio.PE) ; 统计力学 (cond-mat.stat-mech) ; 适应性与自组织系统 (nlin.AO)

2026年01月28日， 星期三 (展示 3 之 3 条目 )

[18] arXiv:2601.22967 (交叉列表自 q-bio.PE) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 食物资源和死亡率的适应如何塑造微生物种群的振荡动力学 显示英文标题

标题： How adaptation to food resources and death rates shape oscillatory dynamics in a microbial population

Elia Mascolo, Réka Borbély, Santiago Herrera-Álvarez, Calin C Guet, Justin Crocker, Gašper Tkačik

主题： 种群与进化 (q-bio.PE) ; 软凝聚态物理 (cond-mat.soft) ; 生物物理 (physics.bio-ph)

[19] arXiv:2602.00193 (交叉列表自 q-bio.PE) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 具有共感染的宿主种群结构下的多菌株SIS动力学 显示英文标题

标题： Multi-strain SIS dynamics with coinfection under host population structure

David Bryant, Celine Scornavacca, David Swofford

主题： 种群与进化 (q-bio.PE) ; 动力系统 (math.DS)

[20] arXiv:2602.00832 (交叉列表自 physics.bio-ph) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 陆地动物的大小和形状 显示英文标题

标题： Size and shape of terrestrial animals

Marc Grimson, Joshua Fan, Courtney L. Davis, Dylan van Bramer, Daniel Fink, Carla P. Gomes

评论： 19页，3个主要图表，7个补充图表，2个扩展数据表（附属文件）

主题： 生物物理 (physics.bio-ph) ; 种群与进化 (q-bio.PE)