计算机科学 > 计算工程、金融与科学
[提交于 2025年8月10日
]
标题: Cardiotensor:用于三维心脏成像方向分析和纤维追踪的Python库
标题: Cardiotensor: A Python Library for Orientation Analysis and Tractography in 3D Cardiac Imaging
摘要: 理解人体心脏的结构需要对其微观组织在不同尺度上的组织进行分析。 随着基于同步辐射的高分辨率成像技术的出现,现在已经可以以微米级分辨率可视化整个心脏。 然而,将这些大型、复杂的体积数据集转化为可解释的、定量的心脏组织描述符仍然是一个主要挑战。 在此,我们介绍了cardiotensor,一个开源的Python包,旨在量化整个或部分心脏成像数据集中的三维心肌细胞取向。 它提供了结构张量分析的高效、可扩展实现,能够提取方向性度量,如螺旋角(HA)、侵入角(IA)和分数各向异性(FA)。 该包支持达到太字节级的数据集,并针对高性能计算环境进行了优化,包括并行和分块处理流程。 此外,cardiotensor还包括追踪功能,用于重建连续的心肌细胞轨迹。 这使得可以根据分辨率,实现从肌原纤维层面的多尺度肌聚集体可视化。 这些功能能够实现心脏组织的详细结构映射,支持对解剖连续性和区域组织的评估。
文献和引用工具
与本文相关的代码,数据和媒体
alphaXiv (什么是 alphaXiv?)
CatalyzeX 代码查找器 (什么是 CatalyzeX?)
DagsHub (什么是 DagsHub?)
Gotit.pub (什么是 GotitPub?)
Hugging Face (什么是 Huggingface?)
带有代码的论文 (什么是带有代码的论文?)
ScienceCast (什么是 ScienceCast?)
演示
推荐器和搜索工具
arXivLabs:与社区合作伙伴的实验项目
arXivLabs 是一个框架,允许合作伙伴直接在我们的网站上开发和分享新的 arXiv 特性。
与 arXivLabs 合作的个人和组织都接受了我们的价值观,即开放、社区、卓越和用户数据隐私。arXiv 承诺这些价值观,并且只与遵守这些价值观的合作伙伴合作。
有一个为 arXiv 社区增加价值的项目想法吗? 了解更多关于 arXivLabs 的信息.