生物大分子

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2025年08月07日， 星期四 (展示 1 之 1 条目 )

[1] arXiv:2508.03709 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： MD-LLM-1：分子动力学大型语言模型 显示英文标题

标题： MD-LLM-1: A Large Language Model for Molecular Dynamics

Mhd Hussein Murtada, Z. Faidon Brotzakis, Michele Vendruscolo

主题： 生物大分子 (q-bio.BM) ; 计算与语言 (cs.CL) ; 机器学习 (cs.LG) ; 计算物理 (physics.comp-ph)

2025年08月06日， 星期三 (展示 1 之 1 条目 )

[2] arXiv:2508.03456 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, 其他]

标题： 用深度学习解码多酚-蛋白质相互作用：从分子机制到食品应用 显示英文标题

标题： Decoding Polyphenol-Protein Interactions with Deep Learning: From Molecular Mechanisms to Food Applications

Qiang Liu, Tiantian Wang, Binbin Nian, Feiyang Ma, Siqi Zhao, Andrés F. Vásquez, Liping Guo, Chao Ding, Mehdi D. Davari

主题： 生物大分子 (q-bio.BM)

2025年08月05日， 星期二 (展示 3 之 3 条目 )

[3] arXiv:2508.01924 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： Pi-SAGE：用于结合亲和力预测的排列不变表面感知图编码器 显示英文标题

标题： Pi-SAGE: Permutation-invariant surface-aware graph encoder for binding affinity prediction

Sharmi Banerjee, Mostafa Karimi, Melih Yilmaz, Tommi Jaakkola, Bella Dubrov, Shang Shang, Ron Benson

期刊参考： PMLR 267，2025

主题： 生物大分子 (q-bio.BM)

[4] arXiv:2508.01799 (交叉列表自 q-bio.BM) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 基于溶剂感知增强的对比多任务学习在药物发现中的应用 显示英文标题

标题： Contrastive Multi-Task Learning with Solvent-Aware Augmentation for Drug Discovery

Jing Lan, Hexiao Ding, Hongzhao Chen, Yufeng Jiang, Ng Nga Chun, Gerald W.Y. Cheng, Zongxi Li, Jing Cai, Liang-ting Lin, Jung Sun Yoo

评论： 10页，4图

主题： 生物大分子 (q-bio.BM) ; 人工智能 (cs.AI) ; 机器学习 (cs.LG)

[5] arXiv:2508.01055 (交叉列表自 cs.LG) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： FGBench：大型语言模型中功能基团级分子属性推理的数据集和基准 显示英文标题

标题： FGBench: A Dataset and Benchmark for Molecular Property Reasoning at Functional Group-Level in Large Language Models

Xuan Liu, Siru Ouyang, Xianrui Zhong, Jiawei Han, Huimin Zhao

评论： 20页，20图

主题： 机器学习 (cs.LG) ; 人工智能 (cs.AI) ; 生物大分子 (q-bio.BM) ; 定量方法 (q-bio.QM)

2025年08月04日， 星期一 (展示 1 之 1 条目 )

[6] arXiv:2508.00578 (交叉列表自 cs.LG) [中文pdf, pdf, html, 其他]

标题： 学习肽中氢原子转移反应的势能面 显示英文标题

标题： Learning Potential Energy Surfaces of Hydrogen Atom Transfer Reactions in Peptides

Marlen Neubert, Patrick Reiser, Frauke Gräter, Pascal Friederich

评论： 19页，12图和4表（参考文献和补充信息包括在内）

主题： 机器学习 (cs.LG) ; 材料科学 (cond-mat.mtrl-sci) ; 化学物理 (physics.chem-ph) ; 计算物理 (physics.comp-ph) ; 生物大分子 (q-bio.BM)