计算机科学 > 机器学习
[提交于 2018年10月30日
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标题: 深度学习在基于细胞遗传学、年龄和突变预测急性髓系白血病预后的应用
标题: Application of Deep Learning on Predicting Prognosis of Acute Myeloid Leukemia with Cytogenetics, Age, and Mutations
摘要: 我们探讨如何利用深度学习(DL)来预测急性髓系白血病(AML)的预后。 来自TCGA(癌症基因组图谱)数据库, 本研究使用了94例AML病例。 输入数据包括年龄、10种常见的染色体核型和23种最常见的突变结果;输出是预后 (诊断到死亡,DTD)。 在我们的DL网络中,自编码器被堆叠起来,形成一个分层的DL模型,从中原始数据被压缩和组织,并提取高层次特征。 该网络用R语言编写,设计用于预测给定病例的AML预后(DTD超过或少于730天)。 DL网络在预测预后方面取得了83%的优异准确率。 作为概念验证研究,我们的初步结果展示了DL在未来使用下一代测序(NGS)数据进行预后预测中的实际应用。
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