计算机科学 > 计算机视觉与模式识别
[提交于 2025年8月10日
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标题: HaDM-ST:组织学辅助差异建模用于空间转录组生成
标题: HaDM-ST: Histology-Assisted Differential Modeling for Spatial Transcriptomics Generation
摘要: 空间转录组学(ST)揭示了基因表达的空间异质性,但其分辨率受限于当前平台。 最近的方法通过苏木精和伊红(H&E)染色的组织学来提高分辨率,但仍有三个主要挑战存在:(1)从视觉复杂的H&E图像中分离出与表达相关的特征;(2)在基于扩散的框架中实现空间精确的多模态对齐;(3)建模不同表达通道中的基因特异性变化。 我们提出了HaDM-ST(基于组织学的ST生成差分建模),这是一种以H&E图像和低分辨率ST为条件的高分辨率ST生成框架。HaDM-ST包括:(i)一个语义蒸馏网络,用于从H&E中提取预测线索;(ii)一个空间对齐模块,强制与低分辨率ST进行像素级对应;(iii)一个通道感知的对抗学习者,用于细粒度的基因水平建模。 在多种组织和物种中的200个基因实验表明,HaDM-ST始终优于先前方法,在高分辨率ST预测中提高了空间保真度和基因水平的一致性。
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