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凝聚态物理 > 软凝聚态物理

arXiv:2509.03671 (cond-mat)
[提交于 2025年9月3日 ]

标题: 应用高斯网络理论模拟细胞骨架丝状物上的马达驱动运输

标题: Applying a Gaussian networking theory to model motor-driven transport along cytoskeletal filaments

Authors:Nadine du Toit (1), Kristian K. Müller-Nedebock (1,2) ((1) Department of Physics, Stellenbosch University, Stellenbosch, South Africa, (2) National Institute for Theoretical and Computational Sciences, Stellenbosch, South Africa)
摘要: 本文建立在最近引入的动力学网络框架之上,并将其应用于建模沿着细胞骨架丝状网络的马达驱动运输。 在此方法中,网络功能描述了马达与可用丝状物位点的周期性结合和解离,同时考虑所有可能的配对,从而实现了对复杂网络中受限运动的场论处理。 在此应用中,动力学网络理论被引入到描述马达蛋白及其货物运动的Langevin动力学的Martin-Siggia-Rose表示中。 结果以网络上马达的集体描述形式呈现,针对两种不同的场景,即均匀和非均匀网络。 对于均匀网络,给出了一个扩散系数,而对于非均匀网络,展示了在网络密度上进行无序平均的各种可能性。
摘要: This paper builds on a recently introduced dynamical networking framework, applying it to model motor-driven transport along cytoskeletal filament networks. Within this approach, the networking functional describes the periodic binding and unbinding of motors to available filament sites,whilst accounting for all possible pairing, enabling a field-theoretic treatment of constrained motion in complex networks. In this application, the dynamical networking theory is introduced into a Martin-Siggia-Rose representation of the Langevin dynamics describing the motion of a motor protein and its cargo. Results are presented in a collective description of motors on a network, for two different scenarios, namely homogeneous and non-homogeneous networks. A diffusion coefficient is presented for homogeneous networks, whilst it is shown that various possibilities remain for disordered averaging over network densities for non-homogeneous networks.
评论: 10页,3图
主题: 软凝聚态物理 (cond-mat.soft) ; 生物物理 (physics.bio-ph)
引用方式: arXiv:2509.03671 [cond-mat.soft]
  (或者 arXiv:2509.03671v1 [cond-mat.soft] 对于此版本)
  https://doi.org/10.48550/arXiv.2509.03671
通过 DataCite 发表的 arXiv DOI

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来自: Nadine Du Toit [查看电子邮件]
[v1] 星期三, 2025 年 9 月 3 日 19:39:59 UTC (23 KB)
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